Pero en el concesionario lo han mirado y no me han dicho nada de ese filtro...
El coche solo tiene unos 6mil kilómetros
No es cuestión de kilómetros, es cuestión de dónde aparcas, que humedad hay en el ambiente, si ha entrado porquería al sistema, etc. El mal olor es por la colonia de bacterias que tienes en el filtro y/o conductos más condensación que se te está creando por diversos factores ambientales. Es más, es mejor mover mucho el coche que poco para esto. Si lo usas poco, malo para ti y bueno para las bacterias. La primera opción es hacer una limpieza con ozono para matar todas las bacterias, pero si te han colonizado el filtro te tocará cambiarlo porque el mal olor volverá rápidamente.
Cerca de donde tengo las plazas de garaje tenemos una gran gotera. En cuanto llueve se queda mucha humedad y es el caldo de cultivo ideal para las bacterias. Al poco los dos coches empiezan a oler mal al arrancar. Pues al Fiat le tocó la primera revisión hace un mes. Lo único que hay que hacerle es cambiar el filtro del habitáculo (es eléctrico). Pues cuando me enseñaron cómo estaba daba asquito. Yo, si hace poco que tengo el filtro, pues tiro de lavado interior y luego desinfección con ozono.